Unité de Bioinformatique génomique et structurale

Thémes de recherche de l'Unité de Bioinformatique génomique et structurale

Structure, stabilité et fonction des protéines

Prédiction de la structure, de la stabilité et de la fonction des protéines à partir de leur séquence en acides aminés.

Simulation du mécanisme de repliement des protéines

Etude du repliement des protéines in silico par des modèles utilisant une représentation simplifiée de la structure tertiaire de la macromolécule. Détection des noyaux de nucléation.

Conformations alternatives des protéines

Etudes des caractéristiques de la séquence et de la structure de certaines protéines dans le but d'expliquer la formation de structures alternatives.

Etude des interactions non-covalentes dans les biomolécules

Etude des interactions de type cation-pi, amino-pi et pi-pi par analyse structurale et calculs de chimie quantique dans les protéines et à l'interface entre protéine et ADN ou entre protéine et ligands.

Interactions protéine-protéine, protéine-ADN et protéine-ligand

Etude de complexes supramoléculaires et conception rationnelle de ligands via des analyses structurales, des approches de chimie quantique et le développement d'un logiciel de docking.

Analyse bioinformatique de génomes

Recherche de motifs de séquence particuliers dans les parties codantes et non-codantes des génomes et de relations avec des caractéristiques cellulaires.

Modélisation dynamique de l'expression des gènes

Analyse de données issues de biopuces et construction de modèles dynamiques sous forme d'équations différentielles, mimant l'évolution temporelle de l'expression des gènes.
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